离心柱法主要是利用离心柱中的硅胶基质吸附RNA,再通过洗涤去除杂质从而得到RNA的一种常用方法。相较于Trizol法,离心柱法因操作简便、耗时短、纯度高等优点而得到广泛应用,但也因其吸附柱规格的限制在大批量操作时具有一定的局限性,此外,针对特殊的样本,其提取的效果也大不如Trizol法好。那么你知道柱式法RNA提取的实验流程和注意事项是什么吗?让我们一起来看看吧!
一、主要的试剂、仪器与耗材
RNA提取试剂盒、氯仿、无水乙醇、RNase free Water、低温冷冻离心机、匀浆器或组织研磨器、微量移液器、通风橱、计时器、1.5ml EP管、2ml EP管等。
二、 提取步骤
1.样品处理:
· 细胞:贴壁细胞每106细胞加入1ml裂解液,吹打混匀。
· 悬浮细胞:植物、动物、酵母每10^6细胞加入1ml裂解液。
· 细菌细胞每107细胞加入1ml裂解液混匀。
· 组织:新鲜或-70℃冻存100mg组织加1ml裂解液,匀浆处理。
2.室温放置5min,使核酸蛋白复合物分离;
3.向匀浆样品中加入0.2ml的氯仿,盖好管盖,剧烈振荡15s,室温放置3-5min;
4.2-8℃,12000rpm离心10min。RNA主要存在于上层水相中把水相转移至新的EP管中(注:不可吸到沉淀);
5.吸附柱前处理:在吸附柱中加入500ul洗柱液,室温放置2min,2-8℃,12000rpm离心2min,弃废液(小Tips:此步可以在第四步离心还剩2min左右的时候进行,这样第四步离心结束就可以直接进行洗柱,而不需要再等时间);
6.在收集的上清中加入200ul无水乙醇混匀,加入吸附柱中静置2min,2-8℃,12000rpm离心2min,弃废液;
7.向吸附柱中加入600ul漂洗液(注:新买的试剂盒中漂洗液还需要加入一定量的无水乙醇,此步一定要确认漂洗液是否加入无水乙醇),2-8℃,12000rpm离心2min,弃废液;
8.向吸附柱中加入600ul漂洗液,2-8℃,12000rpm离心2min,弃废液(注:漂洗液在7-8步共加了两次哦);
9.12000rpm离心2min,弃掉收集管,将吸附柱置于室温数分钟(10-15min)以去除残留的漂洗液(注:最好在通风橱进行,以免RNA酶对RNA的降解;通风橱在使用前也可先紫外30min);
10.将吸附柱放入新管中,向膜中央滴加50-100ul RNase free ddH2O(通常取中间值),室温放置5min,12000rpm室温离心2min即可得到RNA溶液(注:所有步骤中仅最后一步离心是在室温,其余均在2-8℃,因此,前几步离心拿出样品后一定要及时关上离心机盖子,以免升温,而在第9步离心结束后就可以打开离心机盖子使其快速升至室温)。
三、 注意事项
1.佩戴手套、口罩,消毒操作台,杜绝外源酶的污染;
2.所用试剂耗材必须无酶化,有条件者可以直接购买,否则就要做好高压灭菌的工作;
3.得到RNA溶液后可保存于-80℃,避免反复冻融,放置时间不可过长;4.对于组织RNA的提取,一定要充分匀浆处理以使RNA充分释放出来。
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